Factorial_Mixture.ipynb

Kernel: Python 3

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階乗混合

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このノートブックでは、TensorFlow Probability（TFP）を使用して、次のように定義されるガウス分布の階乗混合からサンプルを取得する方法を説明します。$$p(x_1, ..., x_n) = \prod_i p_i(x_i)$$ where: ParseError: KaTeX parse error: Undefined control sequence: \1 at position 133: …gma_{ik}\right)\̲1̲&=\sum_{k=1}^K\…

それぞれの変数 $x_i$ はガウス分布の混合としてモデル化されており、すべての $n$ 変数に対する同時分布はこれらの密度の積です。

データセット $x^{(1)}, ..., x^{(T)}$ がある場合、各データポイント $x^{(j)}$ をガウス分布の階乗混合としてモデル化します: $$p(x^{(j)}) = \prod_i p_i (x_i^{(j)})$$

階乗混合は、少数のパラメータと大量のモードで分布を作成する単純な方法です。

import tensorflow as tf
import numpy as np
import tensorflow_probability as tfp
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
tfd = tfp.distributions

# Use try/except so we can easily re-execute the whole notebook.
try:
  tf.enable_eager_execution()
except:
  pass

TFP を使ってガウス分布の階乗混合を構築する

num_vars = 2        # Number of variables (`n` in formula).
var_dim = 1         # Dimensionality of each variable `x[i]`.
num_components = 3  # Number of components for each mixture (`K` in formula).
sigma = 5e-2        # Fixed standard deviation of each component.

# Choose some random (component) modes.
component_mean = tfd.Uniform().sample([num_vars, num_components, var_dim])

factorial_mog = tfd.Independent(
   tfd.MixtureSameFamily(
       # Assume uniform weight on each component.
       mixture_distribution=tfd.Categorical(
           logits=tf.zeros([num_vars, num_components])),
       components_distribution=tfd.MultivariateNormalDiag(
           loc=component_mean, scale_diag=[sigma])),
   reinterpreted_batch_ndims=1)

tfd.Independent を使用しているところに注意してください。この「meta-distribution」は reduce_sum を、右端の reinterpreted_batch_ndims バッチ次元に対して log_prob に適用します。この場合、これは log_prob を計算するときに、バッチ次元のみを残して変数次元を合計します。これによるサンプリングへの影響はありません。

密度をプロットする

ポイントのグリッドで密度を計算し、モードの場所を赤い星印で示します。階乗混合の各モードは、根底にあるガウス分布の個体変数混合のモードのペアに対応しています。以下のプロットには 9 つのモードがありますが、必要なのは 6 つのパラメータのみです（$x_1$ のモードの場所を指定する 3 つのパラメータと、$x_2$ のモードの場所を指定する 3 つのパラメータ）。逆に、2 次空間のガウス分布の混合には、9 つのモードを指定するために、2 * 9 = 18 個のパラメータが必要となります。

plt.figure(figsize=(6,5))

# Compute density.
nx = 250 # Number of bins per dimension.
x = np.linspace(-3 * sigma, 1 + 3 * sigma, nx).astype('float32')
vals = tf.reshape(tf.stack(np.meshgrid(x, x), axis=2), (-1, num_vars, var_dim))
probs = factorial_mog.prob(vals).numpy().reshape(nx, nx)

# Display as image.
from matplotlib.colors import ListedColormap
cmap = ListedColormap(sns.color_palette("Blues", 256))
p = plt.pcolor(x, x, probs, cmap=cmap)
ax = plt.axis('tight');

# Plot locations of means.
means_np = component_mean.numpy().squeeze()
for mu_x in means_np[0]:
  for mu_y in means_np[1]:
    plt.scatter(mu_x, mu_y, s=150, marker='*', c='r', edgecolor='none');
plt.axis(ax);

plt.xlabel('$x_1$')
plt.ylabel('$x_2$')
plt.title('Density of factorial mixture of Gaussians');

サンプルと周辺密度の推定をプロットする

samples = factorial_mog.sample(1000).numpy()

g = sns.jointplot(
    x=samples[:, 0, 0],
    y=samples[:, 1, 0],
    kind="scatter",
    marginal_kws=dict(bins=50))
g.set_axis_labels("$x_1$", "$x_2$");